Ein kleiner Teil des Gebietes der Stadt Warstein gehört zum Evangelischen Kirchenkreis Soest.

• Die Warsteiner Ortschaft Niederbergheim gehört zur Ev.-Möhne-Kirchengemeinde.
• Die Ortschaft Haarhöfe gehört zur Ev. Kirchengemeinde Neuengeseke.

Warstein selbst gehört zur Ev. Kirchengemeinde Warstein im Kirchenkreis Arnsberg.